protscale的结果得出每个氨基酸的亲水输水数值,怎么确定是什么氨基酸呢?

~ Protscale是一种通过氨基酸序列计算亲水性或疏水性的工具,其结果输出是对于氨基酸序列中每个氨基酸的亲水/疏水性的预测值。一般情况下,预测的亲水性/疏水性值越高,代表该氨基酸越亲水/疏水。因此,可以根据输出结果中亲水/疏水性值的大小来确定每个氨基酸的亲水/疏水性,常见的氨基酸亲水/疏水性排序如下:
亲水性(高到低):R, K, E, D, Q, N, H, S, T, Y, C, W, A, G, M, I, L, V, F, P
疏水性(高到低):W, F, Y, M, L, I, V, C, A, T, G, S, P, H, E, Q, N, D, K, R
在使用Protscale时,需要根据具体研究问题来选择适合的参数设置,并且结合生物学知识和实验结果来解释结果。

根据ProtScale 预测结果,如何判断蛋白质序列的疏水性
答:可能是比较中性,Val疏水值都到4.200了,MAX才1.052 mark,望高人解答。

如何判断氨基酸的疏水性和亲水性?
答:应用ProtScale 程序(http ://expasy.org/cgibin/protscale.pl)进行蛋白质的疏水性分析(直接把氨基酸序列粘贴入空白框内,点确认),得到结果,然后看疏水峰值和亲水峰值的氨基酸所长的百分率,疏水峰值大于0的氨基酸所占的比例超过50%,可以认为氨基酸合成的整个蛋白质表现出疏水性,反之为亲水性!

生物催化和生物降解的数据库及网址有哪些
答:进入google首页,搜索NEBcutter2.0,进入主页,选择linear,运行!选择customdigest,,把“1”改为“4”,选择平末端,后digest。Viewgel。选择1.4%agarose和Marker为100bp。二、结果:然后就是蛋白质的了一般都在expasy里swiss-prot适用于检索的computepi/mw求理论分子量分子量protparam物理化学性质protsc...

列举常用的生物信息学数据库及序列对比常用软件及特点
答:二、结果:然后就是蛋白质的了一般都在expasy里swiss-prot 适用于检索的 compute pi/mw 求理论分子量 分子量 protparam物理化学性质 protscale亲水性疏水性 peptidemass分析蛋白酶和化学试剂处理后的内切产物 NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)-GenBank数据库 数据库相似性搜索——核酸序列与核酸数据库比较(...

protscale的结果得出每个氨基酸的亲水输水数值,怎么确定是什么氨基酸呢...
答:Protscale是一种通过氨基酸序列计算亲水性或疏水性的工具,其结果输出是对于氨基酸序列中每个氨基酸的亲水/疏水性的预测值。一般情况下,预测的亲水性/疏水性值越高,代表该氨基酸越亲水/疏水。因此,可以根据输出结果中亲水/疏水性值的大小来确定每个氨基酸的亲水/疏水性,常见的氨基酸亲水/疏水性排序如下:...

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